La configuración del último nivel para el berilio es 2s², por lo que, para justificar la valencia 2 de este elemento, es preciso promocionar un electrón del orbital 2s a un orbital 2p, quedando la configuración de la capa de valencia de la forma 2s¹2p¹.

El carácter apolar de la molécula indica que los enlaces Be-Cl forman un ángulo de 180º. Para que esto tenga lugar, es necesario que se produzca una hibridación entre un orbital s y uno p, dando lugar a dos orbitales híbridos sp con las mismas características y formando entre sí un ángulo de 180º, de forma que la repulsión entre los electrones sea mínima. Cada uno de los enlaces se formará por solapamiento de uno de estos orbitales híbridos con un orbital 3p del cloro.

A continuación puede verse una animación del modelo de la molécula de BeCl₂, realizada mediante el programa Jmol. Para ver esta animación, pulse sobre el siguiente botón.